Het Geheime Boek van Johannes is een gnostische tekst die een opzienbarend kosmisch verhaal onthult: het bestaan van de mensheid is verstrikt in een bedrieglijke matrix, gemaakt door een valse god, Yaldabaoth.
Dit wezen, voortgekomen uit Sophia's onbedoelde schepping, hult de wereld in onwetendheid en roept zichzelf uit tot de enige schepper, waardoor goddelijke vonken, onze ware essentie, gevangen worden gehouden in een namaakwerkelijkheid. De tekst waarschuwt dat de materiële wereld, met haar lijden en beperkingen, niet het werk is van de ware God, maar een vervorming van de goddelijke perfectie.
Door deze spirituele samenzwering bloot te leggen, biedt het Geheime Boek van Johannes een pad naar bevrijding door middel van kennis (gnosis), waarbij de mensheid wordt aangespoord om te ontwaken voor haar goddelijke oorsprong en los te komen van de illusie. De herontdekking ervan is een oproep om de krachten uit te dagen die ons duizenden jaren blind hebben gehouden voor de waarheid.